莊閑和 【LlamaIndex教程】1. 數據連接模塊教程（附代碼）
2026-01-14大家好，我是同學小張，持續學習C++進階知識和AI大模型應用實戰案例，持續分享，歡迎大家點贊+關注，共同學習和進步。 上篇文章我們通過一個簡單的例子，學習了LlamaIndex的安裝和基本使用，使用 LlamaIndex 構建了一個簡單的RAG問答系統。今天我們開始系統化學習，首先看一下LlamaIndex的Load部分。Load部分負責文件數據鏈接。 0. 文件類型加載器：SimpleDirectoryReader 上篇文章代碼的一開始，我們就使用了這個Reader： fromllama_i
莊閑和 胃癌單細胞數據集GSE163558復現(五)：細胞比例
2026-01-14圖片 前言 Hello小伙伴們大家好，我是生信技能樹的小學徒”我才不吃蛋黃“。今天是胃癌單細胞數據集GSE163558復現系列第五期。第四期，我們使用了DimPlot、FeaturePlot、DoHeatmap、DotPlot等多種函數對細胞群和基因進行了可視化。本期，我們將繪制餅圖、堆積柱狀圖、箱線圖、氣泡圖等，比較不同分組之間細胞比例差異。 1.背景 在細胞分群命名完成之后，我們可以比較不同樣本和分組之間細胞比例的差異。細胞發生癌變、腫瘤細胞轉移、藥物治療等刺激因素，都會導致腫瘤微環境中細
圖片 前言 Hello小伙伴們大家好，我是生信技能樹的小學徒”我才不吃蛋黃“。今天是胃癌單細胞數據集GSE163558復現系列第六期。第五期我們通過繪制餅圖、堆積柱狀圖、氣泡圖等，比較不同分組之間細胞比例差異。本期，我們將下載胃癌bulk數據（TCGA-STAD），篩選胃癌相關差異表達基因，根據差異基因list，使用AddModuleScore_UCell函數給上皮細胞亞群Seurat對象添加惡性評分，以此協助區分正常上皮和惡性上皮。 1.背景介紹 眾所周知，胃癌細胞是胃上皮細胞發生了惡性病變
莊閑和游戲 胃癌單細胞數據集GSE163558復現(七)：評估惡性上皮細胞增殖及遷移能力
2026-01-14圖片 前言 Hello小伙伴們大家好，我是生信技能樹的小學徒”我才不吃蛋黃“。今天是胃癌單細胞數據集GSE163558復現系列第七期。第六期我們根據TCGA數據庫中胃癌和正常胃組織之間的差異表達基因，定義了每個上皮細胞的惡性和非惡性評分。本期，我們將分析惡性上皮細胞G0-G4的Marker基因并繪制熱圖和小提琴圖，此外，我們還將使用AddModuleScore_UCell函數計算細胞的增殖和遷移評分。 建站客服QQ：88888888 1.背景介紹 細胞增殖是生物體的重要生命特征，細胞以分裂的方
莊閑和游戲網 胃癌單細胞數據集GSE163558復現(八)：擬時序分析
2026-01-14圖片 前言 Hello小伙伴們大家好，我是生信技能樹的小學徒”我才不吃蛋黃“。今天是胃癌單細胞數據集GSE163558復現系列第八期。第七期我們使用AddModuleScore_UCell函數計算細胞的增殖和遷移評分。本期，我們將使用monocle2進行擬時序分析。 1.背景介紹 系列推文前七期，我們共同學習了單細胞測序的基礎分析，從第八期開始，我們將陸續學習擬時序分析（Pseudo-Temporal Analysis），“Copykat”分析及細胞通訊等高級分析。 疾病是一個動態變化的過程，
莊閑和 大數據監控了你的手機，教你關閉手機監聽開關，擺脫監控
2026-01-14今天給大家分享一下如何關閉監控的廣告開關，擺脫大數據監控您的手機！大家有沒有感覺我們的手機好像對我們非常了解，仿佛成了最懂我們的那個人，我們每次你剛剛和別人聊完什么，然后手機呢就會給你推送什么，或者說我們剛在某個軟件上買完東西，別的軟件也會給你推送類似的產品，其實這就是現在的大數據互聯網，那么我們怎樣才能避免被跟蹤，怎樣才能保護我們的隱私呢？下面我們就一起來關閉監控的開關吧！ 首先第一步，我們需要去手機的設置里面，把有關于廣告的那些開關按鈕把它關閉。我們點開設置之后呢，直接點擊上方這里的搜索框
莊閑和 胃癌單細胞數據集GSE163558復現(十)：CopyKAT分析
2026-01-14圖片 前言 Hello小伙伴們大家好，我是生信技能樹的小學徒”我才不吃蛋黃“。今天是胃癌單細胞數據集GSE163558復現系列第十期。第九期我們用TCGA-STAD數據進行生存分析。本期，我們將回到高級分析（CopyKAT分析），通過計算CNV評估上皮細胞良惡性。 1.背景介紹 在第六期推文中，我們聯合TCGA-STAD數據給上皮添加了惡性評分，從而協助區分腫瘤細胞與非腫瘤細胞。在高級分析中，我們可以利用inferCNV和CopyKAT對單細胞進行CNV(Copy number variati
莊閑和游戲網 胃癌單細胞數據集GSE163558復現(十一)：T細胞亞群細分
2026-01-14{jz:field.toptypename/} 圖片 前言 Hello小伙伴們大家好，我是生信技能樹的小學徒”我才不吃蛋黃“。今天是胃癌單細胞數據集GSE163558復現系列第十一期。第十期我們使用通過CopyKAT分析計算CNV評估上皮細胞良惡性。本期，我們將對T細胞亞群進行細分。 1.背景介紹 德國哲學家萊布尼茨說過:“世上沒有兩片完全相同的樹葉。”物種是有其多樣性的。對于細胞來說同樣如此。從理論上講，我們可以對細胞亞群進行無限分群。在初次分群時，可以不斷調整分辨率，同樣在細胞注釋之后，我
莊閑和游戲 胃癌單細胞數據集GSE163558復現(十二)：細胞通訊
2026-01-14圖片 前言 Hello小伙伴們大家好，我是生信技能樹的小學徒”我才不吃蛋黃“。今天是胃癌單細胞數據集GSE163558復現系列第十二期。第十一期使用singleR對T細胞亞群進行細分。本期，我們將進入胃癌復現的最后一章，“細胞通訊”。 1.背景介紹 腫瘤微環境中細胞類型、數量以及功能一直處于動態變化的過程，各類型的細胞組成了一個有序的統一體，而細胞之間頻繁的“互動”維持著統一體的動態平衡。這種互動不僅存在于同類型細胞之間，存在與不同類型的細胞間，甚至是單個細胞的不同時間維度上。我們把這種互動，
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